Tüm mikrobiyolojik analizler için kullanılabilecek çeşitli besiyerleri mevcuttur.
En sık kullanılanlar:
Küf-Maya: DRBC Agar, Saboraud Dextrose Agar
Toplam Canlı Bakteri: Plate Count Agar
E.coli/Coliform: VRB Agar (toplam coliform analizi için kullanılır. E.coli'yi ayırt etmek için ileri doğrulama testleri gereklidir)
TBX Agar (E.coli tespitinde kullanılır)
Ayrıca, E.coli ve diğer coliform kolonilerini birbirinden renk farkı ile ayırt etmeyi sağlayan KROMOJENİK özellikli besiyerleri de bulunmaktadır (Ör: ECC Agar)