İşletmelerde bulunan mikrobiyoloji laboratuvarlarında son üründen kullanma suyuna çeşitli mikrobiyolojik analizler yapılır.  Bu analizler esnasında oluşabilecek en ufak bir kontaminasyon sonucun güvenilirliğini etkileyebilir ve üründe olmayan bir mikroorganizmanın gelişmesiyle ya da olan mikroorganizmanın gelişiminin engellenmesiyle vb. doğru değerlendirme yapma imkânı ortadan kalkabilir. Bu nedenle analizler yapılırken kullanılan malzemelerin ve ortamın hijyeni oldukça önemlidir.

Laboratuvarda kullanılan besiyeri, pipet gibi malzemelerin steril olması gerekmektedir. Sterilizasyon bir ortamdaki tüm mikroorganizmaların öldürülmesi ya da ortamdan uzaklaştırılmasıdır. Sterilizasyon için uygulanabilecek çeşitli yöntemler mevcuttur. Bunlardan bazıları; ısı uygulaması, alevden geçirme, basınçlı buharla sterilizasyon, filtre ile sterilizasyondur. Mikroorganizmalar üzerine etkili çeşitli kimyasal maddelerde sterilizasyon amaçlı kullanılabilir.

Alevden geçirme, analiz esnasında steril tüp, erlen gibi malzemelerin ağzı alevden geçirilerek steril tutulmalıdır. Yine öze, pens gibi aletler de aleve tutularak steril edilmelidir. Mikrobiyolojik analiz esnasında bunzen bek açık tutulmalıdır.